ok, te respondo a tus preguntas:
1) ese condensador es electrolítico -son esos cilíndricos chiquititos-.
Si prestas atención en la foto vas a ver que la pata más larga tiene al costado unos símbolos "-", esa es la pata negativa. La mas corta es la positiva. Si lo ponés alreves no va a funcionar.
2) ese es un LED. El símbolo de la resistencia es el que esta antes (las rayitas triangulares). En cuanto al led también prestá atención al tema de las patas
En este caso el lado que se conecta con la resistencia es el positivo.
3) Ese condensador es de poliester. Los condensadores de poliester y los cerámicos no tienen sentido, solamente los electrolíticos tienen patas positivas y negativas. La respuesta a tu pregunta entonces es SI, NO IMPORTA COMO VA PUESTO.
4) todas las conexiones GND van conectadas entre sí. Es decir que 3 y 8 del conector de la DC, las dos patas que quedan de los capacitores y 3 y 6 de la sd van conectadas entre sí.
5) En el conector de la dc, los pines 1, 2 y 9 no se usan. No los conectes.
6) En el conector de la SD los pines 9 y 8 tampoco se usan, por motivos propios a que la sd de dreamcast trabaja en modo SPI y esos pines no se utilizan en este caso. (se utilizan en otra norma de conexión de la sd llamada "modo SD")
Espero que esto les sirva.